Protein–RNA interactions for Protein: Q15369

ELOC, Elongin-C, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOCQ15369 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELOCQ15369 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELOCQ15369 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms