Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CD33-201ENST00000262262 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 UNKL-207ENST00000403703 4281 ntTSL 1 (best)14.45□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 ZBED9-201ENST00000452236 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 SOGA1-204ENST00000465671 4478 ntTSL 214.22□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 JPT2-207ENST00000565851 565 ntTSL 1 (best)13.86□□□□□ -0.198e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 JPT2-208ENST00000566691 601 ntTSL 513.75□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.238e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 DCK-202ENST00000503359 2683 ntTSL 213.5□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-12■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MAPK3-211ENST00000483869 738 ntTSL 312.46□□□□□ -0.418e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 RAB6B-207ENST00000543906 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.478e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 DCK-203ENST00000504730 2401 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 JPT2-210ENST00000566925 570 ntTSL 411.76□□□□□ -0.538e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 WDFY1-203ENST00000462702 361 ntTSL 311.3□□□□□ -0.61e-9■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MAPK3-210ENST00000481230 465 ntTSL 510.91□□□□□ -0.668e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 NEK2-203ENST00000462283 801 ntTSL 210.64□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CD24-203ENST00000615659 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 310.56□□□□□ -0.721e-9■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 NDE1-201ENST00000396354 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MICB-204ENST00000538442 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.798e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 METTL9-206ENST00000564733 5603 nt9.67□□□□□ -0.868e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CD33-205ENST00000598473 4728 ntTSL 29.09□□□□□ -0.958e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -18e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.078e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.158e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.178e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 ARV1-205ENST00000459891 1009 ntTSL 56.77□□□□□ -1.338e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.428e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 LRP8-212ENST00000529670 660 ntTSL 56.15□□□□□ -1.428e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.558e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 NEK2-204ENST00000489633 661 ntTSL 24.25□□□□□ -1.738e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 CD33-206ENST00000600557 536 ntTSL 44□□□□□ -1.778e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 FAM102B-203ENST00000483371 8333 ntTSL 22.63□□□□□ -1.998e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.038e-7■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.513e-13■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.083e-13■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 PTPRA-203ENST00000356147 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.643e-13■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.743e-13■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 PTPRA-202ENST00000318266 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.743e-13■■■■■ 32.1
PABPC4Q13310 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.033e-8■■■■■ 32
PABPC4Q13310 EEF1E1-204ENST00000502429 591 ntTSL 310.48□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 32
PABPC4Q13310 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.433e-8■■■■■ 32
PABPC4Q13310 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.563e-8■■■■■ 32
PABPC4Q13310 MRPL55-225ENST00000465268 848 ntTSL 218.04■□□□□ 0.485e-11■■■■■ 32
PABPC4Q13310 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.733e-7■■■■■ 32
PABPC4Q13310 AC135048.1-202ENST00000562642 626 ntTSL 39.3□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 32
PABPC4Q13310 SSR4-209ENST00000482902 2409 ntTSL 219.67■□□□□ 0.748e-9■■■■■ 32
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PABPC4Q13310 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.618e-9■■■■■ 32
PABPC4Q13310 SSR4-208ENST00000471880 785 ntTSL 517.78■□□□□ 0.448e-9■■■■■ 32
PABPC4Q13310 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.378e-9■■■■■ 32
PABPC4Q13310 SSR4-206ENST00000460616 2482 ntTSL 216.53■□□□□ 0.248e-9■■■■■ 32
PABPC4Q13310 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.28e-9■■■■■ 32
PABPC4Q13310 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 32
PABPC4Q13310 ARHGAP4-223ENST00000494397 1752 ntTSL 525.02■■□□□ 1.65e-7■■■■■ 31.9
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PABPC4Q13310 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ARHGAP4-207ENST00000420383 2817 ntTSL 218.84■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 31.9
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PABPC4Q13310 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 IRF3-231ENST00000602190 413 ntTSL 322.67■■□□□ 1.222e-7■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 SAT1-209ENST00000489394 1135 ntTSL 213.55□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 SAT1-206ENST00000463236 735 ntTSL 37.23□□□□□ -1.252e-9■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ITPA-204ENST00000460550 967 ntTSL 220.16■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ITPA-208ENST00000483354 1028 ntTSL 319.8■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ITPA-209ENST00000490838 977 ntTSL 219.42■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ITPA-207ENST00000472295 670 ntTSL 217.82■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.751e-9■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.412e-9■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.824e-7■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 AK1-205ENST00000550143 532 ntTSL 514.4□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ECI2-208ENST00000478266 1133 ntTSL 520.26■□□□□ 0.835e-17■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.135e-17■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.095e-17■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.095e-17■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ECI2-203ENST00000380120 1469 ntTSL 213.9□□□□□ -0.185e-17■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ECI2-211ENST00000496241 1451 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.215e-17■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ECI2-205ENST00000464057 2122 ntTSL 213.7□□□□□ -0.225e-17■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.045e-17■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 ECI2-206ENST00000464583 3870 ntTSL 27.32□□□□□ -1.245e-17■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 APRT-211ENST00000569616 788 ntTSL 520.22■□□□□ 0.832e-15■■■■■ 31.9
PABPC4Q13310 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 MED24-209ENST00000491466 957 ntTSL 515.51■□□□□ 0.078e-10■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 MED24-214ENST00000535508 3334 ntTSL 213.7□□□□□ -0.228e-10■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.268e-10■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.368e-10■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.428e-10■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.588e-10■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.778e-10■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.414e-12■■■■■ 31.8
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