Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3BQ13214 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3BQ13214 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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