Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RESTQ13127 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RESTQ13127 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RESTQ13127 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RESTQ13127 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RESTQ13127 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RESTQ13127 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RESTQ13127 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RESTQ13127 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RESTQ13127 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RESTQ13127 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RESTQ13127 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RESTQ13127 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RESTQ13127 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RESTQ13127 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RESTQ13127 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RESTQ13127 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RESTQ13127 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RESTQ13127 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RESTQ13127 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RESTQ13127 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RESTQ13127 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RESTQ13127 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RESTQ13127 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RESTQ13127 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RESTQ13127 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RESTQ13127 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RESTQ13127 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RESTQ13127 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RESTQ13127 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RESTQ13127 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RESTQ13127 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RESTQ13127 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RESTQ13127 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RESTQ13127 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RESTQ13127 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RESTQ13127 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RESTQ13127 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RESTQ13127 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RESTQ13127 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RESTQ13127 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RESTQ13127 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RESTQ13127 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RESTQ13127 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RESTQ13127 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RESTQ13127 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RESTQ13127 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RESTQ13127 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RESTQ13127 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RESTQ13127 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RESTQ13127 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RESTQ13127 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RESTQ13127 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RESTQ13127 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RESTQ13127 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RESTQ13127 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RESTQ13127 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RESTQ13127 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RESTQ13127 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RESTQ13127 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RESTQ13127 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RESTQ13127 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RESTQ13127 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RESTQ13127 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RESTQ13127 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RESTQ13127 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RESTQ13127 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RESTQ13127 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RESTQ13127 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RESTQ13127 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms