Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EGR3Q06889 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms