Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNB1Q02641 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNB1Q02641 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNB1Q02641 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms