Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RBP5P82980 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBP5P82980 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBP5P82980 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBP5P82980 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBP5P82980 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBP5P82980 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RBP5P82980 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RBP5P82980 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RBP5P82980 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RBP5P82980 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RBP5P82980 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP5P82980 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP5P82980 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP5P82980 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP5P82980 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP5P82980 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP5P82980 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP5P82980 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP5P82980 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP5P82980 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP5P82980 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RBP5P82980 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP5P82980 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP5P82980 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP5P82980 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP5P82980 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP5P82980 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RBP5P82980 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RBP5P82980 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RBP5P82980 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP5P82980 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP5P82980 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP5P82980 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP5P82980 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP5P82980 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP5P82980 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP5P82980 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP5P82980 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP5P82980 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP5P82980 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RBP5P82980 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RBP5P82980 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms