Protein–RNA interactions for Protein: P61604

HSPE1, 10 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPE1P61604 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSPE1P61604 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPE1P61604 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms