Protein–RNA interactions for Protein: P57076

C21orf59, UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59P57076 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C21orf59P57076 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C21orf59P57076 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms