Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
AP2S1P53680 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AP2S1P53680 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms