Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGGT1BP53609 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGGT1BP53609 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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