Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 NFYB-204ENST00000551446 618 ntTSL 35.36□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2C1-223ENST00000515854 561 ntTSL 44.73□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 SLC38A2-208ENST00000549258 4384 ntTSL 24.37□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 36.1
AARSP49588 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.783e-6■■■■■ 36
AARSP49588 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 36
AARSP49588 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.783e-6■■■■■ 36
AARSP49588 PIP5K1C-204ENST00000587482 1311 ntTSL 517.57■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 36
AARSP49588 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 36
AARSP49588 C17orf99-201ENST00000340363 984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 35.8
AARSP49588 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 35.7
AARSP49588 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 35.7
AARSP49588 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 214.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 35.7
AARSP49588 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 35.7
AARSP49588 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 35.7
AARSP49588 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 35.7
AARSP49588 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 35.7
AARSP49588 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 35.7
AARSP49588 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 35.7
AARSP49588 CEP85-205ENST00000469609 2384 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 35.7
AARSP49588 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 328.8■■■□□ 2.25e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 228.8■■■□□ 2.25e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CD81-214ENST00000530239 425 ntTSL 226.49■■□□□ 1.835e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.825e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CUTC-201ENST00000370472 727 ntTSL 525.61■■□□□ 1.695e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 EIF5A-210ENST00000575001 609 ntTSL 225.43■■□□□ 1.665e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 523.83■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CD81-203ENST00000464784 794 ntTSL 523.81■■□□□ 1.45e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.335e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-221ENST00000582844 957 ntTSL 523.12■■□□□ 1.295e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSTB-202ENST00000480147 2344 nt22.95■■□□□ 1.265e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.255e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 TCHP-206ENST00000544838 2077 ntTSL 222.73■■□□□ 1.235e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.195e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.15e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.15e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 RPL36-208ENST00000590786 907 ntTSL 221.61■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-206ENST00000473439 638 ntTSL 221.55■■□□□ 1.045e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.035e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-239ENST00000622565 756 ntTSL 420.99■□□□□ 0.955e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 SRSF4-206ENST00000605204 1399 ntTSL 1 (best)20.83■□□□□ 0.925e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.925e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 SRSF4-202ENST00000466448 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.5■□□□□ 0.875e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.815e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-208ENST00000550946 1394 ntTSL 1 (best)20.04■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.775e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 AHDC1-203ENST00000480033 546 ntTSL 519.69■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CD81-211ENST00000524805 982 ntTSL 519.59■□□□□ 0.735e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CD81-208ENST00000492252 1136 ntTSL 319.41■□□□□ 0.75e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.695e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CD81-213ENST00000527343 720 ntTSL 319.26■□□□□ 0.675e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-212ENST00000595118 2446 ntTSL 219.11■□□□□ 0.655e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-229ENST00000601032 2019 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.625e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CD81-217ENST00000533417 444 ntTSL 318.79■□□□□ 0.65e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-204ENST00000318809 1700 ntTSL 218.78■□□□□ 0.65e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 DBN1-207ENST00000477391 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.72■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LIG1-204ENST00000542460 1527 ntTSL 218.42■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 218.2■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-209ENST00000594116 420 ntTSL 318.18■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 AKT1-204ENST00000544168 1564 ntTSL 218.14■□□□□ 0.495e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 DBN1-206ENST00000472831 2667 ntTSL 218.05■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 517.8■□□□□ 0.445e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.425e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 UBE2O-202ENST00000586409 3579 ntTSL 217.65■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 AHDC1-205ENST00000490295 511 ntTSL 517.62■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-214ENST00000595665 576 ntTSL 417.45■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-207ENST00000593463 573 ntTSL 417.45■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-218ENST00000597816 692 ntTSL 317.45■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSTB-203ENST00000639959 1855 ntTSL 517.2■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-223ENST00000584472 586 ntTSL 417.2■□□□□ 0.345e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-226ENST00000599724 910 ntTSL 517.09■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 DBN1-209ENST00000506117 477 ntTSL 417.03■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CIC-208ENST00000575839 335 ntTSL 516.97■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CD81-210ENST00000493525 396 ntTSL 516.47■□□□□ 0.235e-10■■■■■ 34.9
AARSP49588 BCL2L13-208ENST00000464649 435 ntTSL 416.3■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 UBE2O-205ENST00000587581 545 ntTSL 416.2■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-237ENST00000622107 590 ntTSL 416.08■□□□□ 0.165e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 LTBP4-202ENST00000243562 3140 ntTSL 215.77■□□□□ 0.115e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 34.9
AARSP49588 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 34.9
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 135.5 ms