Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNC1P48547 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNC1P48547 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms