Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MGAT1P26572 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MGAT1P26572 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms