Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP1P23763 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms