Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 CPNE3-208ENST00000614678 4201 ntTSL 1 (best)5.48□□□□□ -1.534e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 LAP3-203ENST00000504614 813 ntTSL 35.34□□□□□ -1.554e-11■■■■■ 32.6
RPS3P23396 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.64e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CCNB1-205ENST00000507798 767 ntTSL 34.45□□□□□ -1.73e-9■■■■■ 32.6
RPS3P23396 SARS-203ENST00000468588 1582 ntTSL 24.27□□□□□ -1.734e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CPNE3-202ENST00000517391 785 ntTSL 34.08□□□□□ -1.764e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ALYREF-201ENST00000504015 254 ntTSL 33.86□□□□□ -1.794e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.844e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CPNE3-201ENST00000517354 566 ntTSL 42.93□□□□□ -1.944e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CS-232ENST00000552331 526 ntTSL 22.61□□□□□ -1.994e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 CCNB1-207ENST00000513102 463 ntTSL 21.1□□□□□ -2.234e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ADH4-203ENST00000503944 304 ntTSL 50.8□□□□□ -2.284e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 ADH4-205ENST00000504581 315 ntTSL 30.33□□□□□ -2.364e-6■■■■■ 32.6
RPS3P23396 TKFC-219ENST00000534084 964 ntTSL 312.62□□□□□ -0.391e-8■■■■■ 32.6
RPS3P23396 COX4I1-209ENST00000565078 566 ntTSL 414.22□□□□□ -0.139e-10■■■■■ 32.6
RPS3P23396 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.466e-7■■■■■ 32.6
RPS3P23396 VCP-203ENST00000448530 950 ntTSL 519■□□□□ 0.639e-9■■■■■ 32.6
RPS3P23396 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.479e-8■■■■■ 32.5
RPS3P23396 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 216.47■□□□□ 0.239e-8■■■■■ 32.5
RPS3P23396 CNBP-210ENST00000512338 502 ntTSL 413.9□□□□□ -0.185e-10■■■■■ 32.5
RPS3P23396 ECH1-204ENST00000595470 560 ntTSL 212.46□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 32.5
RPS3P23396 ECH1-210ENST00000598316 553 ntTSL 211.56□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 32.5
RPS3P23396 AC010132.3-202ENST00000433579 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.89■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 32.5
RPS3P23396 PSMA2-201ENST00000223321 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 32.5
RPS3P23396 PSMA2-203ENST00000436986 1453 ntTSL 38.75□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 32.5
RPS3P23396 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 32.5
RPS3P23396 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 32.5
RPS3P23396 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.472e-10■■■■■ 32.5
RPS3P23396 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.475e-8■■■■■ 32.5
RPS3P23396 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.25e-8■■■■■ 32.5
RPS3P23396 COL2A1-206ENST00000483376 641 ntTSL 515.96■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 32.5
RPS3P23396 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 32.5
RPS3P23396 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.296e-7■■■■■ 32.5
RPS3P23396 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 32.5
RPS3P23396 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.544e-8■■■■■ 32.5
RPS3P23396 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.654e-8■■■■■ 32.5
RPS3P23396 G3BP2-205ENST00000502654 546 ntTSL 414.05□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 32.5
RPS3P23396 G3BP2-218ENST00000513927 426 ntTSL 310.97□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 32.5
RPS3P23396 G3BP2-210ENST00000507745 584 ntTSL 47.57□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 32.5
RPS3P23396 SYPL1-201ENST00000011473 2127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 32.5
RPS3P23396 SYPL1-202ENST00000455385 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 32.5
RPS3P23396 SYPL1-207ENST00000634737 835 ntTSL 56.61□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 32.5
RPS3P23396 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 32.5
RPS3P23396 QSOX1-203ENST00000392029 1075 ntTSL 520.71■□□□□ 0.914e-7■■■■■ 32.4
RPS3P23396 LDHA-221ENST00000543445 576 ntTSL 35.47□□□□□ -1.531e-12■■■■■ 32.4
RPS3P23396 SLC1A5-204ENST00000593713 774 ntTSL 310.87□□□□□ -0.671e-12■■■■■ 32.4
RPS3P23396 SCP2-209ENST00000478274 969 ntTSL 210.89□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 32.4
RPS3P23396 TCP1-217ENST00000546023 1135 ntTSL 1 (best)24.68■■□□□ 1.541e-15■■■■■ 32.4
RPS3P23396 TCP1-214ENST00000543532 561 ntTSL 423.52■■□□□ 1.363e-9■■■■■ 32.4
RPS3P23396 TCP1-209ENST00000538128 557 ntTSL 422.22■■□□□ 1.153e-9■■■■■ 32.4
RPS3P23396 TCP1-208ENST00000537390 691 ntTSL 519.62■□□□□ 0.733e-9■■■■■ 32.4
RPS3P23396 TCP1-213ENST00000543517 561 ntTSL 418.01■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 32.4
RPS3P23396 TCP1-206ENST00000536607 572 ntTSL 217.33■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 32.4
RPS3P23396 TCP1-210ENST00000538530 918 ntTSL 515.01□□□□□ -0.013e-9■■■■■ 32.4
RPS3P23396 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 32.4
RPS3P23396 C1QBP-203ENST00000573204 911 ntTSL 28.27□□□□□ -1.096e-9■■■■■ 32.4
RPS3P23396 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.677e-9■■■■■ 32.3
RPS3P23396 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 32.3
RPS3P23396 SP1-201ENST00000327443 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 32.3
RPS3P23396 TUFM-204ENST00000569217 814 ntTSL 217.38■□□□□ 0.371e-13■■■■■ 32.3
RPS3P23396 PSMD2-218ENST00000491494 371 ntTSL 216.47■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.471e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 NRM-206ENST00000470733 1453 ntTSL 215.74■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 NRM-207ENST00000474864 1029 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 NRM-205ENST00000462857 1260 ntTSL 213.84□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 NRM-208ENST00000482141 1199 ntTSL 213.3□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 LIPA-204ENST00000428800 1055 ntTSL 1 (best)12.23□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 LIPA-201ENST00000282673 753 ntTSL 38.67□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 32.3
RPS3P23396 NDUFA2-202ENST00000502960 721 ntTSL 216.78■□□□□ 0.283e-10■■■■■ 32.3
RPS3P23396 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.013e-10■■■■■ 32.3
RPS3P23396 NDUFA2-204ENST00000512088 627 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.553e-10■■■■■ 32.3
RPS3P23396 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.484e-8■■■■■ 32.3
RPS3P23396 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.394e-8■■■■■ 32.3
RPS3P23396 BANF1-206ENST00000528648 362 ntTSL 38□□□□□ -1.134e-8■■■■■ 32.3
RPS3P23396 SEMA3B-205ENST00000434030 1011 ntTSL 321.41■■□□□ 1.021e-9■■■■■ 32.2
RPS3P23396 SEMA3B-206ENST00000439487 594 ntTSL 319.05■□□□□ 0.641e-9■■■■■ 32.2
RPS3P23396 PRMT5-215ENST00000554716 561 ntTSL 420.1■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 32.2
RPS3P23396 MRPL22-207ENST00000523037 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 32.2
RPS3P23396 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 32.2
RPS3P23396 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 32.2
RPS3P23396 MRPL22-202ENST00000439747 784 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 32.2
RPS3P23396 MRPL22-204ENST00000519059 511 ntTSL 24.81□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 32.2
RPS3P23396 VARS-225ENST00000482996 728 ntTSL 313.47□□□□□ -0.251e-9■■■■■ 32.2
RPS3P23396 SLIRP-203ENST00000554074 445 ntTSL 36.37□□□□□ -1.395e-12■■■■■ 32.2
RPS3P23396 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.938e-28■■■■■ 32.2
RPS3P23396 DDIT4-203ENST00000473155 753 ntTSL 1 (best)19.79■□□□□ 0.769e-28■■■■■ 32.2
RPS3P23396 YWHAB-208ENST00000633979 689 ntTSL 36.75□□□□□ -1.331e-12■■■■■ 32.1
RPS3P23396 NUP214-219ENST00000528406 393 ntTSL 313.24□□□□□ -0.291e-12■■■■■ 32.1
RPS3P23396 PRKCB-205ENST00000472066 556 ntTSL 312.1□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 32.1
RPS3P23396 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 32.1
RPS3P23396 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 32.1
RPS3P23396 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 32.1
RPS3P23396 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.851e-7■■■■■ 32.1
RPS3P23396 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 32.1
RPS3P23396 PNP-205ENST00000554065 554 ntTSL 46.75□□□□□ -1.333e-10■■■■■ 32.1
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