Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HRCP23327 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HRCP23327 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
HRCP23327 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HRCP23327 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
HRCP23327 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HRCP23327 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
HRCP23327 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
HRCP23327 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HRCP23327 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HRCP23327 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
HRCP23327 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HRCP23327 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HRCP23327 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HRCP23327 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HRCP23327 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HRCP23327 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HRCP23327 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
HRCP23327 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HRCP23327 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
HRCP23327 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HRCP23327 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HRCP23327 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HRCP23327 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
HRCP23327 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
HRCP23327 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
HRCP23327 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
HRCP23327 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
HRCP23327 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
HRCP23327 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
HRCP23327 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HRCP23327 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HRCP23327 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
HRCP23327 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HRCP23327 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HRCP23327 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HRCP23327 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HRCP23327 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HRCP23327 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HRCP23327 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
HRCP23327 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
HRCP23327 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HRCP23327 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
HRCP23327 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HRCP23327 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
HRCP23327 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
HRCP23327 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HRCP23327 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HRCP23327 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HRCP23327 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
HRCP23327 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HRCP23327 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
HRCP23327 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HRCP23327 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
HRCP23327 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HRCP23327 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HRCP23327 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HRCP23327 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HRCP23327 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HRCP23327 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HRCP23327 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HRCP23327 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HRCP23327 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
HRCP23327 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
HRCP23327 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
HRCP23327 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
HRCP23327 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
HRCP23327 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
HRCP23327 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
HRCP23327 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
HRCP23327 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HRCP23327 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HRCP23327 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HRCP23327 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HRCP23327 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HRCP23327 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HRCP23327 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HRCP23327 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HRCP23327 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
HRCP23327 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HRCP23327 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HRCP23327 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
HRCP23327 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HRCP23327 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
HRCP23327 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
HRCP23327 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
HRCP23327 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HRCP23327 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HRCP23327 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HRCP23327 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HRCP23327 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HRCP23327 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HRCP23327 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HRCP23327 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HRCP23327 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
HRCP23327 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
HRCP23327 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HRCP23327 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
HRCP23327 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
HRCP23327 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms