Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMNB1P20700 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMNB1P20700 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms