Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ABCB1P08183 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ABCB1P08183 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms