Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLBP06746 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLBP06746 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLBP06746 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLBP06746 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLBP06746 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLBP06746 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLBP06746 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLBP06746 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLBP06746 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLBP06746 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLBP06746 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLBP06746 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLBP06746 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLBP06746 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLBP06746 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLBP06746 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLBP06746 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLBP06746 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLBP06746 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLBP06746 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLBP06746 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLBP06746 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLBP06746 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLBP06746 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLBP06746 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLBP06746 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLBP06746 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLBP06746 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLBP06746 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLBP06746 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLBP06746 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLBP06746 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLBP06746 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLBP06746 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLBP06746 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLBP06746 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLBP06746 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLBP06746 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLBP06746 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLBP06746 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLBP06746 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLBP06746 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLBP06746 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLBP06746 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLBP06746 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLBP06746 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLBP06746 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLBP06746 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLBP06746 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLBP06746 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLBP06746 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLBP06746 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLBP06746 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLBP06746 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLBP06746 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLBP06746 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLBP06746 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLBP06746 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLBP06746 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLBP06746 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLBP06746 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLBP06746 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLBP06746 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms