Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PRM2P04554 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRM2P04554 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRM2P04554 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRM2P04554 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRM2P04554 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRM2P04554 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRM2P04554 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRM2P04554 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRM2P04554 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRM2P04554 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRM2P04554 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRM2P04554 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRM2P04554 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRM2P04554 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRM2P04554 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRM2P04554 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRM2P04554 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRM2P04554 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRM2P04554 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRM2P04554 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRM2P04554 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRM2P04554 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRM2P04554 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRM2P04554 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRM2P04554 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRM2P04554 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRM2P04554 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRM2P04554 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRM2P04554 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRM2P04554 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRM2P04554 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRM2P04554 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRM2P04554 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRM2P04554 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRM2P04554 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRM2P04554 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRM2P04554 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRM2P04554 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms