Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TBX1O43435 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX1O43435 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX1O43435 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX1O43435 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX1O43435 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX1O43435 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TBX1O43435 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TBX1O43435 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TBX1O43435 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TBX1O43435 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TBX1O43435 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TBX1O43435 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX1O43435 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX1O43435 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX1O43435 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX1O43435 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX1O43435 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX1O43435 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TBX1O43435 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBX1O43435 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBX1O43435 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBX1O43435 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBX1O43435 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBX1O43435 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TBX1O43435 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX1O43435 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX1O43435 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX1O43435 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX1O43435 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TBX1O43435 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms