Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDUFS4O43181 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFS4O43181 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFS4O43181 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDUFS4O43181 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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NDUFS4O43181 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NDUFS4O43181 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFS4O43181 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFS4O43181 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFS4O43181 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFS4O43181 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFS4O43181 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFS4O43181 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFS4O43181 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFS4O43181 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFS4O43181 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFS4O43181 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFS4O43181 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFS4O43181 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NDUFS4O43181 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFS4O43181 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFS4O43181 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFS4O43181 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFS4O43181 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFS4O43181 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NDUFS4O43181 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFS4O43181 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NDUFS4O43181 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFS4O43181 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NDUFS4O43181 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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