Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
SYNJ2O15056 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
SYNJ2O15056 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SYNJ2O15056 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms