Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAFD1O14545 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAFD1O14545 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAFD1O14545 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms