Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAPO00193 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAPO00193 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAPO00193 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAPO00193 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAPO00193 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAPO00193 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAPO00193 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMAPO00193 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMAPO00193 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMAPO00193 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMAPO00193 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAPO00193 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAPO00193 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAPO00193 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAPO00193 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAPO00193 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAPO00193 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAPO00193 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAPO00193 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAPO00193 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAPO00193 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMAPO00193 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAPO00193 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAPO00193 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAPO00193 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAPO00193 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAPO00193 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAPO00193 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMAPO00193 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAPO00193 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAPO00193 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAPO00193 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAPO00193 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAPO00193 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAPO00193 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAPO00193 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAPO00193 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMAPO00193 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAPO00193 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAPO00193 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAPO00193 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAPO00193 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAPO00193 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAPO00193 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAPO00193 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAPO00193 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMAPO00193 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAPO00193 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAPO00193 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAPO00193 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAPO00193 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAPO00193 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAPO00193 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAPO00193 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAPO00193 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAPO00193 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAPO00193 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMAPO00193 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMAPO00193 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMAPO00193 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMAPO00193 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAPO00193 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAPO00193 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAPO00193 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAPO00193 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAPO00193 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAPO00193 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAPO00193 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAPO00193 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAPO00193 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMAPO00193 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAPO00193 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAPO00193 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAPO00193 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAPO00193 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMAPO00193 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms