Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms