Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PGPEP1LA6NFU8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PGPEP1LA6NFU8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms