Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TREX2Q9BQ50 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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