Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms