Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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