Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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HERC3Q15034 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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