Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CNIH4Q9P003 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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