Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSPP1Q1MSJ5 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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