Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
E2F1Q01094 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
E2F1Q01094 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 332.8 ms