Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms