Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GPC3P51654 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPC3P51654 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms