Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMPOP42166 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TMPOP42166 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPOP42166 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms