Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMG5Q9UPR3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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