Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL359510.2-201ENST00000624958 2249 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 ESPNL-203ENST00000409506 3610 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 WASF2-202ENST00000618852 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM3Q9BZL3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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