Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 NR1D1-201ENST00000246672 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TMEM86A-201ENST00000280734 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PTDSS1P48651 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms