Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
XCL2Q9UBD3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms