Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF65

GIPC2, PDZ domain-containing protein GIPC2, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC2Q8TF65 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GIPC2Q8TF65 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GIPC2Q8TF65 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms