Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GAPVD1Q14C86 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC073488.1-201ENST00000416620 1600 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC032044.1-201ENST00000570924 570 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 RN7SL827P-201ENST00000607480 288 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GAPVD1Q14C86 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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