Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TNNI2P48788 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms