Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HDCP19113 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HDCP19113 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HDCP19113 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms