Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCAR2-206ENST00000520861 3560 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5E-201ENST00000257770 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms