Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC96Q2M329 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms