Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CUL4BQ13620 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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