Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CUL3Q13618 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CUL3Q13618 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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